Introdução à Bioquímica/Glossário

Glossário

A

• Ácido forte – ácido que se dissocia totalmente na sua base conjugada e protões quando em solução.
• Ácido fraco – ácido que se dissocia parcialmente na sua base conjugada e protões quando em solução, estabelecendo-se um equilíbrio entre as espécies ionizadas e o ácido.
• Aeróbio – processo, mecanismo ou organismo que utiliza dioxigénio.
• Aeróbio facultativo – organismo que pode utilizar dioxigénio no seu metabolismo mas sobrevive sem este. Por exemplo: Escherichia coli.
• Aeróbio obrigatório – organismo que não sobrevive na ausência de dioxigénio, necessitando deste para o seu metabolismo energético. Por exemplo: humanos.
• Aldose - monossacarídeo contendo um grupo aldeído na sua estrutura.
• Aminoácido – molécula contendo um grupo amina e um grupo carboxílico; bloco básico de construção de péptidos e proteínas.
• Anabolismo – tipo de metabolismo em que é consumida energia para a síntese de biomoléculas necessárias à célula.
• Anaeróbio – processo, mecanismo ou organismo que não utiliza dioxigénio, podendo ou não ser destruído/inutilizado na presença deste.
• Anaeróbio aerotolerante – organismo que não utiliza dioxigénio no seu metabolismo mas é capaz de sobreviver na sua presença.
• Anfipático – diz-se do composto que possui uma parte hidrofílica e uma parte hidrofóbica. Por exemplo: fosfoacilgliceróis.
• Anfotérico – diz-se do composto que pode actuar como base e como ácido simultaneamente.
• Ångström – unidade de comprimento equivalente a 10^-10m, muito usada na apresentação de distâncias entre átomos em estruturas tridimensionais de biomoléculas (especialmente proteínas).
• Anião – espécie química carregada negativamente (ião com carga eléctrica negativa).
• Animalia – reino (divisão taxonómica) à qual pertencem todos os animais.
• Antibiótico – substância sintetizada por microrganismos (ou artificialmente) que destrói ou inibe o crescimento de outros microrganismos. Por exemplo: a penicilina.
• Anticodão – sequência de três nucleótidos de tRNA complementar a uma sequência de três nucleótidos de mRNA (codão) que identifica qual o aminoácido correspondente a esse codão.
• Antiparalelo – diz-se do arranjo das duas cadeias de DNA em dupla hélice por se entrelaçarem em sentidos opostos (ou seja, uma cadeia no sentido 5'–3' entrelaça-se com uma cadeia no sentido 3'–5').
• Apoenzima – parte proteica de uma enzima, ou seja, sem a presença de cofactores não proteicos.
• Átomo – a mais pequena partícula da matéria que conserva identidade química.
• Autotrofia – síntese de biomoléculas usando CO₂ como fonte de carbono. Por exemplo, a fotossíntese é um processo autotrófico.

B

• Bactéria – microrganismo unicelular procariótico, que não possui organelos ou um núcleo definido.
• Beta-oxidação (β-oxidação) – via catabólica de oxidação de ácidos gordos, em que estes são degradados a pequenas moléculas orgânicas.
• Bicamada lipídica – camada de natureza dupla constituída por fosfoacilgliceróis, de tal modo que a parte hidrofílica ("cabeças") destes esteja em contacto com o meio aquoso envolvente e a parte hidrofóbica ("caudas") esteja no interior da camada.
• Biorremediação – processo que emprega microrganismos com capacidade de transformar substâncias tóxicas em não-tóxicas. Usada, por exemplo, na limpeza de águas efluentes contaminadas.
• Biossíntese – síntese de moléculas usadas em processos bioquímicos. Requer o gasto de energia química, normalmente sob a forma de ATP.

C

• Cascata – em Bioquímica, refere-se à transmissão de informação através de várias reacções, observando-se um aumento progressivo do sinal pretendido.
• Catabolismo – tipo de metabolismo em que existe degradação de biomoléculas mais ou menos complexas para haver libertação de energia.
• Catião – espécie química carregada positivamente (ião com carga eléctrica positiva).
• Centro activo – Zona de uma enzima onde o substrato se liga e é transformado a produto.
• Centro alostérico – Zona de uma enzima onde uma molécula (que não o substrato) se liga, modulando a actividade enzimática (estimulando-a, especificando-a ou inibindo-a).
• Cetose - monossacarídeo contendo um grupo cetona na sua estrutura.
• Cloroplasto – organelo presente em células eucarióticas fotossintéticas, que contém a maquinaria necessária para a fotossíntese.
• Constante de acidez – constante de dissociação de um ácido, definida como a razão entre o produto das concentrações de H⁺ e da base conjugada e a concentração do ácido. Dá uma medida da extensão da dissociação do ácido em solução.

D

• Desprotonação – perda de um ou mais protões (H⁺) por uma molécula, dizendo-se que fica desprotonada.

E

• Energia de activação – energia necessária para iniciar uma reacção química. É diminuída na presença de enzimas.
• Enzima – proteína com características catalíticas, ou seja, que catalisa reacções químicas em sistemas vivos.
• Epímero - monossacarídeo que difere de outro apenas na conformação quiral de um carbono.
• Equilíbrio químico – situação de estado estacionário de uma reacção química reversível em que não existe uma variação líquida da concentração de reagentes ou de produtos, ou seja, em que a reacção directa procede à mesma velocidade que a reacção inversa.

F

• Fermentação alcoólica – processo metabólico em que o piruvato é reduzido pelo NADH a etanol.
• Fórmula de projecção de Fischer - forma de representação da estrutura de monossacarídeos em que o grupo carbonilo se desenha próximo do topo, ligações químicas desenhadas na vertical consideram-se atrás do plano e na horizontal acima do plano. É particularmente útil para determinar o tipo de enantiómero (D ou L) representado.

G

• Glícido – substância química composta por carbono, hidrogénio e oxigénio, que tem um papel de reserva/fonte de energia, estrutural ou de sinalização celular (quando ligado a proteínas membranares).

H

• Hexose - monossacarídeo contendo seis carbonos na sua estrutura.
• Heptose - monossacarídeo contendo sete carbonos na sua estrutura.
• Hidrofílico – diz-se do composto que possui afinidade para a água, sendo solúvel nesta. Por exemplo: glucose.
• Hidrofóbico – diz-se do composto que repele a água, sendo insolúvel nesta. Por exemplo: ácidos gordos.
• Holoenzima – enzima completa com cofactores não proteicos. O termo é aplicado quando é necessário distinguir esta da apoenzima.

I

• Ião – espécie química com carga eléctrica, adquirida pelo ganho (anião) ou perda (catião) de electrões.
• Isótopo – diz-se de átomos que, possuindo a mesma massa atómica, diferem no seu número atómico.

L

• Ligação de hidrogénio – ligação química fraca (23 kJ/mol) que se estabelece entre um átomo com alta electronegatividade (como o oxigénio) e um átomo de hidrogénio.
• Ligação química – interacção entre os electrões de valência de átomos de modo a que estes atinjam uma configuração electrónica de valência estável (de menor energia).
• Lipofílico – diz-se do composto que é solúvel num meio constituído por lípidos, como as membranas celulares (cf. hidrofóbico).

M

• Massa atómica – soma do número de protões e de neutrões existentes num átomo.
• Membrana citoplasmática – bicamada lipídica que determina a divisão entre o interior da célula (meio intracelular) e o seu ambiente (meio extracelular), tendo entre outros um papel de compartimentação, regulação osmótica e transporte de substâncias.
• Molécula orgânica – designação geral dada a moléculas constituídas por pelo menos uma cadeia de átomos de carbono ligados entre si.

N

• Nomenclatura binomial – sistema de nomenclatura dos organismos vivos, criado por Lineu, para a designação de uma espécie por dois nomes, o primeiro designando o género a que pertence a espécie (em maiúscula) e o segundo sendo um epíteto específico (em minúscula). O nome deve ser destacado usando sublinhado ou itálico. Por exemplo: Helicobacter pylori (uma bactéria existente no estômago de parte da população humana).
• Número atómico – número de protões de um átomo, que define a que elemento químico esse átomo pertence.

P

• Par conjugado ácido/base – par constituído por um ácido e respectiva forma desprotonada (base). Por exemplo: HCl/Cl^-.
• Parede celular – invólucro exterior presente na maioria das células de plantas, fungos e procariontes que confere rigidez e forma à célula, protegendo-a também da entrada de substâncias nocivas e evitando a ruptura celular em condições hipotónicas.
• Pentose - monossacarídeo contendo cinco carbonos na sua estrutura.
• Peso atómico – o mesmo que (e mais correctamente designado como) massa atómica.
• pH – escala logarítmica que relaciona a concentração de iões H⁺ em solução aquosa com a acidez dessa solução.
• Ponte de hidrogénio – o mesmo que (e mais correctamente designada como) ligação de hidrogénio.
• Proteína transmembranar – diz-se da proteína que atravessa totalmente uma membrana, estabelecendo uma via de comunicação entre os dois compartimentos definidos por essa membrana. Têm geralmente uma função de sinalização celular ou transporte.
• Protonação – ganho de um ou mais protões (H⁺) por uma molécula, dizendo-se que fica protonada.

Q

• Quimioautotrofia – tipo de autotrofia em que é usada a oxidação de compostos inorgânicos simples (por exemplo, nitritos) para a produção de energia química.
• Quimiosmose – processo de produção de ATP através de um gradiente de protões, criado previamente através de uma membrana por transporte activo.
• Quitina – homopolissacarídeo estrutural, consituído por N-acetilglucosamina. Encontra-se na parede celular de diversos fungos e é um componente essencial do exoesqueleto de artrópodes.

R

• Respiração aeróbia – denominação do processo global de catabolismo energético em que moléculas orgânicas são oxidadas através do ciclo dos ácidos tricarboxílicos e da fosforilação oxidativa a produtos como o CO₂ e H₂O.

S

• Solução aquosa – solução em que o solvente principal (ou o único solvente) é água. Todos os fluidos biológicos são soluções aquosas.

T

• Teoria celular – teoria desenvolvida por Matthias Schleiden e Theodor Schwann, em meados do século XIX, que afirma que todos os organismos são constituídos por células e estas são então a unidade fundamental de construção da vida.
• Tetrose - monossacarídeo contendo quatro carbonos na sua estrutura.
• Transporte activo – tipo de transporte de espécies químicas através de membranas celulares contrariando o gradiente de concentração existente através dessa membrana. Requer energia (ATP) para ser efectuado e dá-se através de proteínas transmembranares.
• Triose - monossacarídeo contendo três carbonos na sua estrutura.

V

• Via anabólica – via metabólica cujo balanço global energético é negativo (é consumida energia) para a síntese de moléculas necessárias à célula.
• Via anfibólica – via metabólica que, em determinadas condições, serve para produzir energia e noutras condições para a síntese de metabolitos.